Việc thực hiện bộ phim thứ hai này được xác nhận vào tháng 9 năm 2006 với kế hoạch khi đó là sẽ công chiếu vào khoảng tháng 1 năm 2008 với độ dài 90 phút. Vào tháng 11 năm 2006 thì tạp chí chuyên về anime là Newtype đã khẳng định là cốt truyện của phim đã được viết từ ngay khi bộ phim đang được hoàn tất. Anno đã công bố là các nhân vật mới sẽ bắt xuất hiện từ phim thứ hai này. Thời điểm công chiếu đã bị dời lại nhiều lần so với kế hoạch ban đầu và kế hoạch cuối cùng là công chiếu vào đầu mùa hè năm 2009 và phim đã công chiếu vào ngày 27 tháng 6 năm 2009.